广州 [切换城市]

广州站

单细胞ATAC测序分析服务

更新时间:2020/6/28 14:59:55信息编号:1039-2420766
所属分类:
商务服务 其他商务服务 
所在区域:
广州 海珠
详细地址:
广州市海珠区粤科华南检测技术装备园A1栋512-513,409
联 系 人:
向远
电  话:
18028560893
收录查询: 百度 搜狗 360   分享更易传播
赶驴网提醒您:1、在办理服务前请确认对方资质, 夸大的宣传和承诺不要轻信!2.任何要求预付定金、汇款至个人银行账户等方式均存在风险,谨防上当受骗!
详细介绍
Single Cell ATAC-seq
ATAC-seq(Assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing)是基于高通量测序的染色质开放性研究,染色质开放区域是染色质中呈松散状态、可发生DNA复制和基因转录的区域,ATAC-seq 使用改造 Tn5转座酶,捕获染色质开放区,将测序接头引入开放染色质的两端,用于表观遗传、基因调控研究g~a~n~l~v~5~c~o~m。ATAC-seq 与其他染色质开放性检测技术相比,具有操作简单、省时省力、无需抗体富集、样本起始量低等显著优势。
图1 ATAC-seq技术原理[1]

单细胞测序技术优势
单细胞测序技术作为微量细胞、稀少样本、细胞异质性的完美解决方法,自技术推出以来,已广泛应用于肿瘤、免疫、发育、神经、微生物等研究领域g+a+n+l+v+5+c+o+m。细胞异型性是细胞之间的重要差异,仅使用组织样本进行二代测序,会掩盖样本的真实结果,无法进行细胞层面的研究。如下图所示,进行组织层面的测序,三个样本之间并无差异,但其实样本中存在不同表达状态的细胞,只有使用单细胞测序,才能揭示样本的真实情况,精准研究细胞异质性g.a.n.l.v.5.c.o.m

图2 细胞异质性

单细胞ATAC技术原理
拥有75万种不同的barcode凝胶珠(barcoded gel beads),基于其核心的微流控技术形成油滴包裹的GEM(Gel Beads-in-emulsion),每个GEM中只包含一个核和一个特定序列的barcode凝胶珠,一个特定barcode序列标记一个细胞核的所有序列,因此可通过barcode序列追溯细胞来源。
实验流程
转座酶处理:使用改造Tn5转座酶,捕获染色质开放区,将测序接头引入染色质开放区的两端ganlv5.com
细胞核标记:将Tn5转座酶处理后的样本加入10x芯片,利用barcode标记细胞来源,形成油滴包裹的GEM。
文库构建:基于Tn5转座酶引入的测序接头构建文库赶 驴 网

 图3单细胞ATAC技术原理 

单细胞ATAC优势
低成本:每个细胞成本远远低于传统单细胞测序、组织测序;
短周期:1h即可完成Tn5转座酶对染色质开放区域的切割;
高通量:7min即可完成1,000-80,000个细胞核的标记;
大数据:可获得多至万个细胞的数据,不依赖于抗体捕获,全面性研究染色质开放区域;
专业软件:配套官方可视化软件。

应用方向


研究领域应用范围广——干细胞、发育分化、肿瘤、免疫、神经系统等来源www.ganlv5.com

分析内容
基于染色质开放区域和转录因子motif富集进行细胞的分群和鉴定;
分析转录起始位点和调控区域;
比较不同细胞的染色质开放程度差异。

图4 单细胞ATAC部分分析内容展示
参考文献:
 [1] Buenrostro Jason D,Giresi Paul G,Zaba Lisa C et al. Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of open chromatin, DNA-binding proteins and nucleosome position[J]. Nat.Methods, 2013, 10: 1213-8.


温馨提示:单细胞ATAC测序分析服务”由用户自行发布,信息内容的真实性、准确性和合法性由发布人负责。虽然部分网友认证了账号,但是并不代表没有风险。赶驴网不提供任何保证不参与交易,亦不承担任何法律责任。
广州其他商务服务全部地区
天河其他商务服务海珠其他商务服务越秀其他商务服务白云其他商务服务荔湾其他商务服务番禺其他商务服务黄埔其他商务服务花都其他商务服务萝岗其他商务服务南沙其他商务服务经济开发区其他商务服务增城其他商务服务从化其他商务服务广州周边其他商务服务
广州其他商务服务热门城市
北京其他商务服务上海其他商务服务深圳其他商务服务广州其他商务服务成都其他商务服务天津其他商务服务苏州其他商务服务杭州其他商务服务武汉其他商务服务郑州其他商务服务南京其他商务服务济南其他商务服务青岛其他商务服务重庆其他商务服务西安其他商务服务宁波其他商务服务石家庄其他商务服务沈阳其他商务服务厦门其他商务服务长沙其他商务服务
广州其他商务服务周边城市
广州其他商务服务深圳其他商务服务东莞其他商务服务珠海其他商务服务汕头其他商务服务佛山其他商务服务江门其他商务服务中山其他商务服务惠州其他商务服务茂名其他商务服务韶关其他商务服务湛江其他商务服务肇庆其他商务服务梅州其他商务服务汕尾其他商务服务河源其他商务服务阳江其他商务服务清远其他商务服务潮州其他商务服务揭阳其他商务服务云浮其他商务服务
广州其他商务服务周边服务
广州工商注册广州签证广州物流广州建材广州翻译服务广州商标专利广州印刷包装广州展览展会广州礼品广州网络维护/布线广州会计审计广州办公设备维修广州法律咨询广州租赁广州投资理财广州网站建设推广广州贷款担保广州其他商务服务广州保险广州喷绘招牌广州咨询广州设计策划广州起名风水广州产品供应加工广州快递
全国其他商务服务最新信息
长沙生产日期喷码,打码机,激光油墨喷码机顺丰同城招聘配餐快递员远成(天津)企业管理2024年最新招聘便利店货架的价格是天津北辰档案馆招聘天津宝涞精工集团股份有限公司招聘上海正规产前亲子DNA鉴定很方便,现场护士全程无创采样上海正规亲子DNA鉴定中心地址表格,新整理全地区办理窗口快干胶低白化 低气味uv胶固化速度快AB胶透明度高